据台湾媒体报道，M503航线距离台湾海峡中线仅有7.8公里，台方担忧，该航线开启后恐危及台湾往返金门、马祖的飞航安全，台湾空防更可能受到冲击。但据中国大陆民航局表示，该航线为民航航线，大陆空管部门与台湾方面会保持技术性沟通。

值得一提的是，M503航线处在所谓“海峡中线”以西靠近大陆一侧，台湾方面声称，该航线离“海峡中线”最近距离“只有7.8公里”。而海峡最窄处只有130公里，“中线”以西的最窄处仅65公里，7.8公里少吗?

《中日防务部门海空联络机制直通电话有望尽快建设》据台湾联合新闻网1月4日报道，1月3日12时10分许，澎湖“海巡队”双艇共同于苗栗通霄西32海里处，发现116吨的大陆籍渔船“闽狮渔027XX”号，正在拖网作业，登检后发现船上共有大陆籍侯姓船长（49岁）等9人及渔获400公斤，以“越界”捕鱼为由，将该艘渔船及船员就近押返台中“海巡队”侦办。